A intervenção cirúrgica bariátrica, mais realizada para o controle da obesidade grave é a gastropartição associada a reconstrução do tipo Y de Roux, conhecida por bypass gástrico. Ela modifica a microbiota intestinal e resulta em grande aumento nas Gamaproteobacterias (membro da família da Enterobacterias), e diminuição proporcional de Firmicutes. Como a operação altera a anatomia e fisiologia de todo o TGI, modifica a microbiota intestinal e pode gerar um super crescimento bacteriano.
A suplementação diária com Lactobacillus no pós operatório de bypass gástrico mostrou benefícios como perda de peso significantemente maior do que no grupo placebo, em seis semanas pós operatório. Após três meses, houve o grupo com suplemento probiótico mostrou melhor absorção de vitamina B12 e menor super crescimento bacteriano.
