As análises do microbioma humano tiveram início com o “Projeto Microbioma Humano” e consiste no conjunto de procedimentos necessários para mapear e interpretar o perfil do microbioma de uma pessoa. O perfil do microbioma é a distribuição de frequência das centenas de espécies de microrganismos que habitam o nosso corpo. A parte referente ao mapeamento deste perfil está bem resolvida: usando uma técnica de sequenciamento genético conhecida como “16s rRna”, ou uma outra técnica mais precisa apelidada de “shotgun”, é possível identificar as diversas espécies de microrganismos, e sua respectiva abundância relativa, presentes em uma amostra. A técnica 16s sequencia apenas uma parte (regiões v3, v4 ou v5) de um gene, o16s, para identificar uma bactéria. A técnica de shotgun sequencia todo o genoma. Por este motivo, a 16s tem custo mais baixo do que a shotgun. Por outro lado, a shotgun consegue identificar mais de 99% dos gêneros e espécies presentes em uma amostra, ao passo que a precisão de identificação da 16s fica em torno de 95% a nível de gênero e 50% a nível de espécie. Adicionalmente, a shotgun identifica também vírus e fungos, microrganismos que não são passíveis de identificação pela 16s. o”. O processo de sequenciamento do microbioma intestinal é relativamente simples: o paciente envia uma pequena amostra de fezes, um pouco maior do que um grão de arroz, para a avaliação.
A análise do microbioma humano pode desempenhar papel relevante em prevenção, diagnóstico e tratamento de distúrbios da saúde. Já existem algumas empresas no mundo que oferecem regularmente o serviço de sequenciamento de microbioma humano. Nos EUA temos a Ubiome, na Inglaterra a MapMyGut, e aqui no Brasil a Bioma4me já oferece este serviço.
Leia mais sobre o assunto na Série Microbioma:
- O que é simbiose e disbiose?
- Como a disbiose intestinal pode contribuir para o surgimento de doenças?
- Quais são os fatores que afetam o microbioma intestinal?
Referências:
JOVEL, Juan et al. Characterization of the Gut Microbiome Using 16S or Shotgun Metagenomics. Frontiers In Microbiology, [s.l.], v. 7, p.1-17, 20 abr. 2016. Frontiers Media SA. http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2016.00459.
KUCZYNSKI, Justin et al. Experimental and analytical tools for studying the human microbiome. Nature Reviews Genetics, [s.l.], v. 13, n. 1, p.47-58, jan. 2012. Springer Nature. http://dx.doi.org/10.1038/nrg3129.
METHÉ, Barbara A. et al. A framework for human microbiome research. Nature, [s.l.], v. 486, n. 7402, p.215-221, 13 jun. 2012. Springer Nature. http://dx.doi.org/10.1038/nature11209.
RANJAN, Ravi et al. Analysis of the microbiome: Advantages of whole genome shotgun versus 16S amplicon sequencing. Biochemical And Biophysical Research Communications, [s.l.], v. 469, n. 4, p.967-977, jan. 2016. Elsevier BV. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbrc.2015.12.083.
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